Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem35bQ3U0Y2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem35bQ3U0Y2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem35bQ3U0Y2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem35bQ3U0Y2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem35bQ3U0Y2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem35bQ3U0Y2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem35bQ3U0Y2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem35bQ3U0Y2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms