Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KhsrpQ3U0V1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KhsrpQ3U0V1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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