Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Palb2Q3U0P1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms