Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms