Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc17a7Q3TXX4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc17a7Q3TXX4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc17a7Q3TXX4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc17a7Q3TXX4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc17a7Q3TXX4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc17a7Q3TXX4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc17a7Q3TXX4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc17a7Q3TXX4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc17a7Q3TXX4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc17a7Q3TXX4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc17a7Q3TXX4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc17a7Q3TXX4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc17a7Q3TXX4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc17a7Q3TXX4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc17a7Q3TXX4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc17a7Q3TXX4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc17a7Q3TXX4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc17a7Q3TXX4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a7Q3TXX4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a7Q3TXX4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a7Q3TXX4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a7Q3TXX4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a7Q3TXX4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a7Q3TXX4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a7Q3TXX4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a7Q3TXX4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a7Q3TXX4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a7Q3TXX4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a7Q3TXX4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a7Q3TXX4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc17a7Q3TXX4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc17a7Q3TXX4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc17a7Q3TXX4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc17a7Q3TXX4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms