Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmd1Q3TXS7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmd1Q3TXS7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmd1Q3TXS7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmd1Q3TXS7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmd1Q3TXS7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmd1Q3TXS7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmd1Q3TXS7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Psmd1Q3TXS7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Psmd1Q3TXS7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms