Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccndbp1Q3TVC7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
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