Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c3Q3TMP1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms