Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cwc27Q3TKY6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cwc27Q3TKY6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cwc27Q3TKY6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms