Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEI4

Uncharacterized protein C15orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TEI4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TEI4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TEI4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TEI4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TEI4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TEI4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TEI4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TEI4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TEI4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TEI4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms