Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cul4aQ3TCH7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms