Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem104Q3TB48 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem104Q3TB48 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem104Q3TB48 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem104Q3TB48 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms