Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9Z9

Zufsp, Zinc finger with UFM1-specific peptidase domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZufspQ3T9Z9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZufspQ3T9Z9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZufspQ3T9Z9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms