Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI48

Jsrp1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jsrp1Q3MI48 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jsrp1Q3MI48 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms