Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnnm3Q32NY4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnnm3Q32NY4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms