Protein–RNA interactions for Protein: Q2MH31

Smrp1, Spermatid-specific manchette-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smrp1Q2MH31 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smrp1Q2MH31 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smrp1Q2MH31 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms