Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp1aQ2LKU9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms