Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Edem3Q2HXL6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edem3Q2HXL6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edem3Q2HXL6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms