Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
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Shroom4Q1W617 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
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Shroom4Q1W617 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
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Shroom4Q1W617 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Shroom4Q1W617 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
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Shroom4Q1W617 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
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Shroom4Q1W617 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
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Shroom4Q1W617 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Shroom4Q1W617 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
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Shroom4Q1W617 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
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Shroom4Q1W617 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
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Shroom4Q1W617 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Shroom4Q1W617 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Shroom4Q1W617 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
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Shroom4Q1W617 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
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Shroom4Q1W617 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
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Shroom4Q1W617 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Shroom4Q1W617 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
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Shroom4Q1W617 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Shroom4Q1W617 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Shroom4Q1W617 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Shroom4Q1W617 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Shroom4Q1W617 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Shroom4Q1W617 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Shroom4Q1W617 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Shroom4Q1W617 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Shroom4Q1W617 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Shroom4Q1W617 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Shroom4Q1W617 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Shroom4Q1W617 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Shroom4Q1W617 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Shroom4Q1W617 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Shroom4Q1W617 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Shroom4Q1W617 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
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