Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms