Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms