Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ubxn2bQ0KL01 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubxn2bQ0KL01 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms