Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ssrp1Q08943 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms