Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata4Q08369 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms