Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calb2Q08331 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms