Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
F13bQ07968 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
F13bQ07968 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
F13bQ07968 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
F13bQ07968 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
F13bQ07968 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
F13bQ07968 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
F13bQ07968 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
F13bQ07968 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
F13bQ07968 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
F13bQ07968 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
F13bQ07968 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
F13bQ07968 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
F13bQ07968 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
F13bQ07968 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
F13bQ07968 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms