Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms