Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Thbs3Q05895 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs3Q05895 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms