Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk18Q04899 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cdk18Q04899 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk18Q04899 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms