Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox13Q04891 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms