Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sox12Q04890 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sox12Q04890 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms