Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox10Q04888 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox10Q04888 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms