Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Emx1Q04742 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Emx1Q04742 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms