Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Smarcad1Q04692 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms