Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnb1Q03717 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154 ms