Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scg2Q03517 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scg2Q03517 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms