Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl7Q03366 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms