Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs2Q03350 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms