Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hivep1Q03172 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hivep1Q03172 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms