Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk7Q03147 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms