Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms