Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snai1Q02085 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snai1Q02085 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snai1Q02085 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms