Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uba1Q02053 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Uba1Q02053 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms