Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ly9Q01965 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms