Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Grin2bQ01097 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Grin2bQ01097 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms