Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde1bQ01065 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde1bQ01065 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms