Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrcdQ00LT2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms