Protein–RNA interactions for Protein: Q00898

Serpina1e, Alpha-1-antitrypsin 1-5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1eQ00898 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Serpina1eQ00898 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Serpina1eQ00898 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Serpina1eQ00898 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpina1eQ00898 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Serpina1eQ00898 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms