Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd80Q00609 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd80Q00609 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd80Q00609 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd80Q00609 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd80Q00609 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd80Q00609 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd80Q00609 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd80Q00609 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd80Q00609 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd80Q00609 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd80Q00609 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd80Q00609 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd80Q00609 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd80Q00609 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd80Q00609 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms