Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms